حقوق گمرکی یا به طور کلی « حقوق ورودی » معمولا همان است که طبق تعرفه ی گمرکی تعیین شده و یا می شود.(طبق مندرجات جدول ضمیمه مقررات صادرات و واردات)،اظهار کننده کالا نیز به همین جدول یا تعرفه گمرکی که نرخ این حقوق مشخص می کند،مراجعه می کند،ولی در مواردی بر خلاف جدول تعرفه ی گمرکی عمل می شود.
مثلا طبق ماده واحده یا قانون خاص ممکن است حقوق گمرکی یا حقوق ورودی کمتری برای کالای یک ردیف از تعرفه - که دارای نرخ معینی است - تعیین شده باشد یا طبق موافقت نامه ها ی دو یا چند جانبه حقوق ورودی کمتری ( اصطلاحا ترجیحات تعرفه ای ) مقرر گردیده باشد،و بالاخره به موجب مصوبه خاصی ، حقوق ورودی به مناسبت معینی کمتر از نرخ مقرر برای اشخاص ، یا حتی منطقه معین تعیین شده باشد.اینها از مواردی است که غیر از مندرجات جدول ضمیمه مقررات عمل می شود.